冈上肌肌腱损伤的治疗要根据损伤的程度决定治疗方案。
轻微的损伤，患者出现肩关节的酸痛或刺痛，受凉后加重，上肢外展和上举无明显限制，磁共振检查肌腱的水肿，无明显断裂或断裂的面积较小，可以采取保守治疗，上肢悬吊4周，口服非甾体类消炎镇痛药物，局部物理治疗。如红外线照射、电磁治疗，促进炎症和水肿吸收。
重度的疼痛剧烈、夜间无法入睡、上肢不能外展或上举，磁共振检查肌腱有断裂，需要在关节镜下进行修复治疗。