枕大神经痛对大脑是有一定的伤害的，疼痛的时候比较剧烈，有可能会导致精神不振，过度的烦躁不安，也有可能会影响脑部的血液循环，导致脑部供血、供氧不足。
枕大神经痛，如果反复的发作，有可能会导致头痛，也有可能会诱发脑出血。有的病人可能演变为蛛网膜下腔出血，出现呕吐和脑膜刺激症的症状。反复的疼痛发作，也有可能导致后颅窝肿瘤或者颈椎病、三叉神经痛等。
患有枕大神经痛，应该应用营养神经的药物以及做针灸、按摩、小针刀等治疗，要尽快的控制病情方发展，如果出现了并发症，应该积极的对症治疗。