核磁共振只能查出一部分早期的癌症。任何一种检查方式都不是万能的，而且每一个脏器，每一种疾病适合的影像学检查方法是不同的。
比如腹部的脏器或者是软组织，一般选择做核磁共振效果会更好一些，比较容易发现一些早期的病变；而小器官一般用超声检查会比较好一些；肺部、头部，以及骨骼系统选择CT检查会更好一些。
但是这些检查方法只能是初步判断患者是否有问题，最终确诊是否是早期的癌症，还需要进一步做增强的影像学检查。有的即便通过增强检查也无法确诊，多数还需要通过取病理做活检才能够确定。