核磁共振能够检查出脑梗。不但可以确定脑梗塞，还能够区分梗塞和出血，并能够很好地明确脑梗塞的部位、范围以及组织水肿的情况。
主要是因为核磁共振是依靠氢质子成像，所以对梗塞区水分的改变更为敏感，所以也比其他的影像学检查方式，能够更早而且更好地显示出梗塞灶。
一般情况下核磁共振在脑缺血出现几个小时以后，就可以发生核磁共振信号的变化，六个小时基本上所有的患者都能够发现这种改变。特别是近几年来弥散成像的应用，对一些早期的脑梗塞诊断的价值会更高一些，所以核磁共振目前是脑梗塞诊断的首选影像学检查方式。