肠胃炎会造成肠道菌群失调。
肠胃炎临床上又分为急性肠胃炎和慢性的肠胃炎，会导致患者出现阵发性腹部疼痛，如疼痛症状比较严重，还会影响到患者的生活和工作。由于炎症的刺激会导致患者出现腹泻、便血、肠道病变严重时还会导致肠道狭窄、穿孔甚至会发生恶变。肠胃炎症会导致患者出现急性的腹泻，有害菌逐渐增多时还会导致肠道菌群失调。
另外，部分患者是属于慢性肠炎，由于长期大量使用广谱抗生素，往往的抗生素会导致肠道的敏感菌群和正常菌群被抑制或者是杀死，有害菌大量增殖时，导致患者出现菌群失调，从而诱发便秘或腹泻等症状。