慢性骨髓炎通常需要手术治疗才能彻底治愈。骨髓炎是因为细菌感染后，致病菌经血液循环到达长骨骨骺引起的感染，通过针对性抗感染治疗，可以控制病情，待全身症状明显改善后，需要积极进行手术治疗。
急性骨髓炎治疗过程中，如果死骨形成就转变为慢性骨髓炎。因感染周围存在有死骨，即使经过正规治疗，死骨也不能完全吸收，后期局部形成包壳，也会影响到骨髓炎的治疗。
所以，如果骨髓炎转变为慢性骨髓炎，一般都需要行手术治疗。慢性骨髓炎主要治疗措施就是在抗感染过程中，应用手术方法将病灶完全切除，移位带血管的皮瓣填补缺损部位，或者行负压吸引促进创面愈合。如果是关节周围骨髓炎，长期慢性反复发作影响到肢体活动，必要时，可以行手术截肢。