胆脂瘤根据大小和位置的不同，会造成不同的危害。
很多胆脂瘤的患者前期没有明显的临床症状，但随着疾病的进一步发展，可以出现很多的临床并发症，比如外耳道胆脂瘤前期可能会出现耳部的疼痛。随着肿物的增大，会出现耳闷、耳内有堵塞感的情况。由于耳朵被肿物堵塞，患者会出现患侧的听力减退。
如果胆脂瘤受到感染，出现破溃，会有反复流脓的情况。有些患者甚至会因为胆脂瘤的感染侵犯神经而导致面瘫，中耳胆脂瘤和颅内胆脂瘤的并发症也都不完全一样。