桥本甲减和甲减在临床上不完全一样。桥本甲减指的是，桥本甲状腺炎发展成甲状腺功能减退的情况。而甲状腺功能减退，指的是各种原因导致的甲减。也就是甲状腺功能减退的范围更大一些，而桥本甲减是甲减的一种。
桥本甲减在临床上作为最常见的一种原发性甲减的病因，在诊断时一般要看甲状腺功能的状态以及甲状腺抗体的情况。而甲减是一种自身免疫性疾病，在体内可以发现多种甲状腺相关抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体、甲状腺球蛋白抗体和促甲状腺激素受体抗体。而其他类型的甲减大多抗体是阴性的，如手术或者外伤所引起的甲状腺功能减退，虽然甲状腺激素水平偏低，但是抗体是阴性的。而中枢性甲减，TSH和T3、T4都是低的。
通过这些不同，可以区分桥本甲减和甲减。