如果能够保证空腹状态，同时医院也开放下午胃镜检查，下午也可以做胃镜检查。
胃镜检查一般要求空腹6~8小时以上，因此如果能够保证这种空腹状态，下午和晚上也可以做胃镜检查。但是空腹时间过长，可能导致胃蠕动加快，在胃镜检查特别是清醒状态下的胃镜检查时，胃蠕动快检查所需要的时间会更长，内镜下治疗的风险可能会增加。
此外由于下午检查，检查者不能进食的时间过长，容易有饥饿不适或低血糖症状。因此绝大多数检查者选择上午进行胃镜检查，而多数医院也把普通胃镜安排在上午进行。
对于急诊胃镜检查，只要病人空腹且一般情况允许，可以根据病情需要进行检查。