目前的屈光手术很少遗留后遗症。
以往的屈光手术最常见的后遗症有过矫、欠矫。过矫是导致患者出现远视，欠矫是矫正度数不够，患者仍有近视的症状。术后患者对于光线会比较敏感，出现眩光症状，多在3~6个月左右逐渐恢复。部分患者也可在术后出现另一类分泌减少导致眼睛干涩的症状，这种情况也可以逐渐恢复，一般在3~6个月左右好转。
但是对于在全飞秒手术而言，上述后遗症的发生率明显减少，并且手术准确率明显提高，是目前最为先进的角膜激光手术。