当患有肾结石时行手术治疗肯定有风险。根据患者肾结石的大小、多少以及患者的年龄和体能状态不同，行肾结石手术治疗时的风险不同。
如果患者年轻无其他基础性疾病，且肾结石较小，肾结石手术的难度系数就较低，手术风险就相对较小。而且年轻患者自身免疫力较强、术后恢复较快，发生手术后并发症的可能性就较小。
如果患者年龄较大、体能状态较差，且患有高血压、糖尿病等基础疾病，肾结石手术前的麻醉风险较高，出现心脑血管意外的可能性较大。而且此类患者对手术的耐受性弱，术后恢复慢且容易出现肾脏或肾周感染。所以，肾结石患者是否予以手术治疗，需要根据患者的具体情况来综合评估，而且要做好手术并发症的预防。