多系统萎缩并没有特异性的治疗办法去治愈，只能够采取支持对症的治疗来缓解患者的一些临床症状。
首先，针对多系统萎缩造成的体位性低血压，可以选择适当的高盐饮食。同时在夜晚睡眠时，将床头轻度抬高。此外，对于体位性低血压严重的患者，也可以选择米多君等药物治疗。
而对于患有排尿障碍以及帕金森综合征的患者，可以适当地给予左旋多巴对症治疗，但是这些患者服用左旋多巴的疗效相对较差。此外，还要注意患者的功能康复训练，以防止患者出现肌肉萎缩以及关节僵硬。总体来说，多系统萎缩的患者预后较差。