用针灸疗法治疗小儿顿咳，在不同的阶段采用不同的方法。
初咳期症状与感冒类似。症见咳嗽、打喷嚏。治疗以宣肺解表、祛邪、止咳为主。针灸处方选择风门穴、列缺穴、合谷穴。痉咳期咳嗽逐渐加重，呈阵发性发作，治疗以清热、泻肺、化痰、止咳为主。针灸处方选择大椎穴、身柱穴、尺泽穴、丰隆穴。
恢复期的顿咳咳嗽次数和持续时间逐渐减短，治疗以健脾补肺为主。针灸处方选择肺腧、脾腧、太渊、足山里。如患儿不配合针刺治疗，可采用指针疗法，以指代针。