心肌炎的原因很多，可以是由病毒引起，也可以由其他原因所引起。临床上心肌炎的原因，主要包括感染性的原因和非感染性的原因。
感染性的原因包括病毒、细菌、真菌、立克次体、螺旋体、原虫、蠕虫等；非感染性的原因包括药物、毒物、放射、结缔组织病、血管炎、结节病等。其中病毒感染引起的病毒性心肌炎，是造成心肌炎的最主要的原因。
临床上的心肌炎，绝大多数是病毒性心肌炎，多种病毒都有可能引起病毒性心肌炎，其中柯萨奇b组病毒，是最为常见的致心肌炎病毒。