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绝大部分的心肌炎是由病毒感染引起的，其中柯萨奇B组病毒最为常见，占到病毒感染的百分之三十至五十，其他的有疱疹病毒、孤儿病毒、脊髓灰质炎病毒等。 心肌炎的发生其中一个原因就是病毒感染，更重要的是病毒与机体的免疫反应，白细胞中的T淋巴细胞接到免疫损伤，T淋巴细胞攻击心肌细胞，导致心肌细胞的直接损伤或是供血不好引起的心肌细胞损伤。 长期疲劳，睡眠不足，导致免疫力抵抗力下降，这时候病毒容易攻击我们身体，这也是引起心肌炎的一个原因。
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