轻微肛瘘也必须做手术，肛瘘一旦形成，药物等保守治疗只能暂时缓解症状，只有通过手术才能彻底根治肛瘘。
肛瘘是由内口、瘘管和外口组成，内口在肛管内肛窦处，外口在肛周皮肤上，中间通过瘘管相连接，如果不处理内口就会不断的有脓液，经瘘管从外口流出，只有切除内口、切开瘘管，让正常组织从底部生，完全愈合，消除了瘘管才能使肛瘘治愈。
得了肛瘘要及时手术治疗，以免反复发作，影响括约肌和肛门功能。