消化不良的患者需要到医院的消化内科就诊，如果是儿童需要到医院的儿科门诊就诊。
假如患者消化不良症状较为严重，并且导致患者体重下降、消瘦、乏力等症状较为明显，有引起反复的呼吸道感染疾病时，有可能需要到医院完善相关的辅助检查，需要做血常规检查，观察血红蛋白、血小板数量以及白细胞数目，需要做大便常规的检查，必要时还需要完善电子肠镜的检查以及大便的培养。
根据检查结果合理使用促消化的药物以及各种益生菌类药物。