足太阴脾经主要用于治疗与脾胃相关联的疾病，主要治消化系统的疾病，如胃脘部的胀痛、食后出现的腹痛、呕吐、嗳气等、包括大便的溏薄、身体出现沉重无力的感觉、舌根部的疼痛，都可以通过足太阴脾经来进行治疗。
因为足太阴脾经通过经别与脾脏相连接，所以脾胃功能异常的情况，会通过足太阴脾经上的腧穴表现出来。
同时足太阴脾经还可以治疗脾经在体表循行的区域的疾病，比如循行区域出现的肢体和关节的疼痛等。