肛裂当然可以通过手术治疗。肛裂的手术治疗包括肛裂切除以及肛管松解术，这是目前临床最安全可靠的手术方式。一般适用于二期、三期肛裂，手术的目的是切除肛裂以及附属物，对肛管做降压处理。
手术时需要切除慢性溃疡的裂口以及裂口周围的瘢痕组织、肥大的肛乳头、哨兵痔以及皮下瘘等。另外，还需要切断肛门部分内括约肌，使肛管降压，缓解括约肌痉挛。
在肛裂通过使用药物及扩肛等其他保守治疗，仍然无法控制症状时，就需要考虑手术治疗。