在通常情况下，有机磷中毒都会出现呼吸困难。
有机磷中毒会影响呼吸，是因为有机磷的毒性会刺激延髓的呼吸中枢，引发呼吸加速、呼吸频率增快。另外有机磷中毒后，毒素还会引起肺泡的渗出液增多，因此会进一步影响呼吸，引发呼吸困难。
有机磷中毒导致的呼吸困难，和毒性强弱直接有关。例如强度高的有机磷，会直接引起延髓呼吸中枢的抑制，会引发急性呼吸骤停。弱毒性的有机磷入侵体内后，也会逐渐引起患者呼吸困难，血氧饱和度下降、二氧化碳分压增高。长时间的有机磷中毒，还会引起呼吸衰竭。