做电子肠镜的前一天并不需要空腹。但是检查前一天患者应该以流质，或者半流质饮食为主，避免一些纤维非常粗无法消化的食物，例如毛笋、芹菜等。
由于肠道准备药物的改进，目前电子肠镜检查的肠道准备多采用渗透性泻药，常用的有聚乙二醇6000散。一般在检查当天凌晨开始服用，需要在检查前4~6个小时开始服用肠道准备药物，然后提早半个小时到1个小时去医院等待检查。
但各个医院的肠道准备方法可能会有所区别，具体患者应以预约检查医院的意见为准。