做肠镜前一天需要做好肠道准备，排空肠道内的粪便。检查的前一天饮食要清淡，进食容易消化的半流质食物，可以吃一些面条、面包、粥类、豆制品等。但是不能进食高纤维素的食物，检查前一天晚上进食后8点钟以后不能再进食任何食物。
还要口服泻药，比如甘露醇、聚乙二醇电解质散等。聚乙二醇电解质散需要兑水1000mL，在2个小时之内喝完，排出肠道内的粪便，直到排出清水一样的大便就可以做肠镜检查了。只有排空肠道内的粪便才能为肠镜提供一个清晰的视野，有利于发现肠道内的病变。做肠镜时患者要放松心情、放松肛门括约肌，有利于肠镜进入肠道。