做肠镜前患者需要做清洁肠道的准备。
首先，患者前一天不要吃纤维素含量高的水果、蔬菜，晚上6点之后不要进食。
其次，一般做肠镜前4-6个小时要口服清洁肠道的泻药，比如聚乙二醇电解质散，一般需要配2~4升水，现喝现配。喝完清肠药后，患者需要来回走动，当最后一次排便是清水时一般达到了清肠的要求，如果患者排便时还有粪渣，可以灌肠或追加泻药。
患者需要一位家属陪伴，因为电子结肠镜检查有一定风险，可能出现肠出血或穿孔等并发症。另外，部分患者是在全麻下做，术后需要将患者推回病房。