孕妇打HPV疫苗有害处。女性打HPV疫苗后，疫苗刺激人体的免疫系统，发生免疫反应，产生抵抗人乳头瘤病毒的抗体，起到预防人乳头瘤病毒感染、降低宫颈癌发病率的作用。
打HPV疫苗后，可能会出现头晕、头痛、疲乏无力、恶心、呕吐，注射部位瘙痒、红肿、硬结等症状，个别女性可能会出现腹泻、心律不齐、过敏等。
孕妇由于体内孕育着胎儿，体质特殊，抵抗力下降，容易受到外界的各种有害因素，比如细菌、病毒、农药、药物、X射线、毒物等侵犯，引起胎儿发育不良。如果孕妇打HPV疫苗，有可能会对孕妇和胎儿产生不良的影响，导致胎儿发育不良，甚至引起胎儿畸形。孕妇最好等生完孩子，身体完全康复之后再打HPV疫苗。