胃内隔膜没有特殊有效的治疗药物。主要的治疗原则是根据患者的临床表现，给予口服对症处理的药物，严重的患者有可能需要通过手术治疗。
手术之前需要纠正患者的水、电解质失衡以及营养不良等。如果胃扩张较明显，还需要放置胃管，胃肠减压可以减轻胃黏膜的水肿。比较常用的手术方式包括胃部分切除术或者是选择性的迷走神经切断术等，具体的手术方式要根据个人情况决定。
手术后要饮食清淡，多吃新鲜蔬菜、水果，要戒烟、戒酒，并且避免吃辛辣、刺激性较强的食物。