十二指肠壅积症预后会有一定的后遗症，但是具体后遗症取决于患者的治疗方式。
假如患者主要的治疗方式是手术治疗，并且手术过程顺利，一般后遗症较少，部分患者可能会出现粘连性的肠梗阻或者是急性腹膜炎的症状。如果出现了粘连性的肠梗阻，并且症状较为严重，有引起肠坏死，有可能需要再次进行手术治疗，因此具体情况具体分析。手术后有可能会导致患者出现消化不良以及反复腹泻症状，部分患者还可能会出现体重下降以及营养不良等症状。
在日常生活当中需要养成良好的生活习惯，饮食结构要合理搭配，并且需要少量多餐的吃一些容易消化、容易吸收的食物，对于后遗症的缓解有一定的作用。