膝关节滑膜炎和滑囊炎主要是在解剖结构上有所不同。滑囊主要是位于关节附近的肌间隙处，类似于保护垫的性质，能减轻膝关节活动时不同肌肉、肌腱之间的摩擦，对膝关节起到一定的保护作用。而滑膜是关节囊最内层的结构，位于关节腔内，能够分泌出液体润滑关节，防止关节软骨受到过度磨损。
膝关节滑膜炎和滑囊炎大多都为无菌性炎症所引起，所导致的临床症状也相似，都会引起膝关节部位压痛、关节肿胀、膝关节活动障碍等症状。在确诊以后，主要是通过药物治疗和物理治疗，在严重时都需要进行手术治疗。
因此，膝关节滑膜炎与滑囊炎既有区别，也有相同点。