肠结核晚期有可能会导致患者出现生命危险。
因为肠结核的患者有可能会出现消瘦、免疫力下降，导致患者出现其他病原微生物的感染的感染性疾病，也可能会导致患者出现肠梗阻以及肠穿孔，部分患者还可能会在腹腔内形成脓肿，导致患者出现生命危险。有肠结核的患者在选择用药上需要规律联合使用抗结核的药物，而且要严格遵照抗结核药物的使用规则。
一旦明确疾病的诊断需要立即到医院，并且合理使用抗结核的药物，避免上述并发症的发生，同时要高蛋白饮食增强免疫力。