长期维生素B1缺乏，最常见是脚气病，另外还可以引起周围神经病及心脏的疾病，会分别表现为四肢末梢麻木、无力、胸闷、气短、心慌，严重时会引起心衰，表现为右心衰、纳差、恶心、呕吐、浮肿。
维生素B1的缺乏主要是由于摄入不足或者是丢失过多，通常是因为长期吃精致大米、饮酒、腹泻或者有甲亢，小儿生长导致维生素B1需求量增加。所以通常要平时吃一些糙米，洗米的时候不要次数太多，要吃一些肉食、坚果类以及蔬菜等富含维生素B1的食物，避免单纯的素食导致摄入不足，同时戒酒，这些都是预防维生素B1的缺乏的注意事项。
维生素B1缺乏的时候，除了补充维生素B1，还要补充烟酸、维生素B2、B6和B12。