清理肠胃的方法包括药物和膳食的应用。一般如果患者存在大便干燥、便秘、腹胀，或者需要完善胃肠镜检查时，需要进行清理肠胃。
药物方面，可以应用乳果糖，对于长期便秘的患者效果比较好，在润肠通便的同时可以恢复肠道的节律性。聚乙二醇电解质散可以有效地清理肠道、排宿便，同时可以预防电解质紊乱。另外，其它的药物，比如芦荟胶囊等也可以达到清理胃肠的作用，但为防止结肠黑变病，应注意避免长期服用。在日常膳食方面，蜂蜜水可以达到润肠、清理肠道的效果，另外可以多喝绿茶也可以促进肠道蠕动。
除了以上方法平时还要注意多吃新鲜的蔬菜、水果，饮食要清淡，适当运动也可以促进肠胃的动力，达到清理肠胃的功效。