原发性膜性肾病对治疗的反应虽然不佳，但大多数患者的预后相对良好。其肾脏的10年存活率可达到70%到90％，并有大约三分之一患者的病情可以自然缓解。影响原发性膜性肾病预后的因素主要有以下几个方面：
1、年龄：儿童患者的预后明显好与成年人，很少走向肾功能衰竭；
2、性别：女性患者的预后优于男性，而且治疗缓解率高，走向肾功能衰竭的少；
3、蛋白尿的程度：伴有明显肾病综合征患者的预后不良；
4、肾功能状况：诊断时就发现肾功能损害的患者走向终末期肾衰的风险明显增高；
5、血压：有人报道，收缩压136到150毫米汞柱的患者走向终末期肾衰的比例为40%，而收缩压在90到120毫米汞柱的患者只有14.3%；
6、肾脏组织学改变：出现肾小管间质严重病免者预后较差。