真菌性食管炎需要复查，这与该疾病的治疗周期较长，并且容易反复有一定的关系。
建议在治疗后的第3、6、12个月做食管内镜的检查，通过食管内镜的检查，可以直接观察到食管内黏膜恢复的情况，并且可以根据病情的变化，调整用药方案。
对于该疾病的治疗，主要是给患者选择抗真菌药物以及胃黏膜保护药物来治疗，可以选择伊曲康唑、酮康唑、氟康唑、两性霉素B以及奥美拉唑、硫糖铝等药物来促进疾病的缓解。如果有出现严重并发症，可能需要给患者手术治疗。