新生儿巨细胞病毒感染是由人类巨细胞病毒感染所导致的疾病，更昔洛韦是治疗症状性先天性巨细胞病毒感染的首选药物。但是，鉴于巨细胞病毒感染的普遍性以及病毒治病的复杂性，而且该药仅能抑制病毒的复制，不能杀灭病毒，长期应用可以引起耐药性以及远期的毒副反应。
因此，应该严格掌握更昔洛韦的应用指征。对无症状性巨细胞病毒感染，或者轻症，尤其是生后感染，可以暂时不应用该药。另外需要治疗巨细胞病毒感染所导致的并发症，有听力障碍者应该早期干预，必要时，可应用人工耳蜗。