对于肉毒杆菌中毒以后，首先患者要快速地进行洗胃。尤其是在确诊肉毒杆菌中毒的六个小时之内，可以快速给患者通过洗胃、导泻、灌肠、利尿、吸附等方式去除肉毒杆菌，造成进一步在体内吸收的情况。
另外，要给患者注意保持呼吸道的通畅，卧床休息，严重时可给患者进行氧气吸入、氧疗。
另外，如果确诊为重度的肉毒杆菌中毒，导致患者出现神经系统的症状，可以在患者发病的二十四小时之内使用多价肉毒抗毒血清进行注射。