卵巢囊肿也有的人是会有并发症的，比如很多卵巢囊肿长到一定的体积，就可能发生扭转的问题。尤其是卵巢畸胎瘤，会因为内部的密度不均匀而有导致扭转的可能性，尤其是在突然变换体位的时候。
也有一部分卵巢囊肿会发生破裂的问题，比如卵巢巧克力囊肿或者是输卵管卵巢脓肿等。也有的卵巢囊肿时间久了就会有变性的问题出现的可能。
也有的卵巢囊肿会有感染的问题存在，常常就会有明显的腹痛或者是发热症状等。所以有的卵巢囊肿需要尽早的做手术治疗才可以的。