卵巢囊肿容易引起一些并发症，比如卵巢畸胎瘤，随着囊肿逐渐长大容易发生蒂扭转，引起急腹症，导致卵巢出现缺血坏死。
如果是患有巧克力囊肿还容易发生卵巢破裂，引起大出血等情况，严重的甚至会出现生命危险，少数卵巢囊肿还有可能会发生癌变等现象。所以女性如果B超检查发现有卵巢囊肿，需要配合医生做进一步检查，确诊囊肿性质。
如果是良性囊肿，囊肿小于5厘米，而且没有对卵巢产生不良影响，暂时不需要治疗。如果卵巢囊肿超过5厘米或者对卵巢功能产生不良影响，都需要尽早手术治疗。