诊断先天性肾病综合征，它的主要依据是阳性家族史，患儿出现大量蛋白尿，有巨大胎盘，出生后6个月内肾功能正常时，必要时，应进行肾穿刺活体组织检查。根据孩子是否存在肾脏以外的症状，需要考虑是单发型或者综合征型的先天性肾病综合症。再根据表型与基因型的关系进行相关基因的检测。在鉴别诊断方面需要与一些先天性肾病综合症相似的疾病进行鉴别，包括弥漫型系膜硬化，婴儿肾病综合症继发于全身疾病，比如先天性梅毒伴有肾病综合征，伴有生殖器畸形的肾病综合症，肾胚胎瘤以及肾静脉血栓。