巧克力囊肿会影响怀孕，患有巧克力囊肿的女性容易不孕，而且很难受孕。很多患者都会选择保守治疗，但有些患者会选择手术治疗。也有很多巧克力囊肿的患者成功受孕，但是比较少见，建议患者及时进行手术治疗。
任何的病症一定要早发现、早治疗，每一名患者的治疗方式根据自身身体情况都不尽相同。有病后一定要多注意休息，不应食用寒凉性质的食物，如生凉瓜果或冰凉饮料、食品等。保持精神愉快，避免劳累，生活要有规律，要加强营养，要相信医生的，积极配合医生的治疗方案。