腱鞘囊肿是否做手术与囊肿的大小以及引起的临床症状有关。如果囊肿较大，并且出现了刺痛和胀痛感，影响到了肢体日常的活动。并且保守疗法没有效果，在此种情况下可以进行手术治疗。
在术前需要对局部进行麻醉，在手术时能够将囊肿以及包膜全部切除，从而避免腱鞘囊肿的复发。
对于不太严重的腱鞘囊肿，主要是以保守治疗为主。在疼痛严重时可通过口服止痛类药物缓解，比如布洛芬、萘普生等。要限制肢体频繁活动，还可将囊内的液体抽出，然后向内注射糖皮质激素类的药物予以治疗。