胃食管反流有可能会引起食管癌，但并不是所有的患者都会发生食管癌。该疾病除了会引起食管癌的并发症以外，还可能会出现上消化道出血以及食管狭窄等并发症。
该类疾病的治疗目的是控制症状并且减少复发，预防并发症的发生。主要口服药物的种类是促胃肠动力药以及抑制胃酸分泌药，同时也需要口服抗酸药物。部分食管狭窄的患者，有可能需要在胃镜下行食管扩张手术。
假如患者通过口服药物治疗效果较好，也需要定期到医院复查，同时也需要积极的治疗。