多数急性链球菌感染后，肾小球肾炎具有自限倾向，因此其治疗主要为对症处理、防治并发症、保护肾功能、促进肾脏结构及功能的恢复。
急性期患者应卧床休息，通常2到3周，直至肉眼血尿消失、水肿消退、血压恢复正常、血清肌酐正常之后，可逐步增加户外活动。急性期还应限制水盐摄入，若有氮质血症者应限制蛋白摄入量，对高钾血症者宜限制钾盐摄入，同时配合利尿，以防止水钠潴留加重导致严重并发症。
对急性期有咽痛、皮肤感染灶者，应给予青霉素或其他链球菌敏感的抗生素治疗。对急性期有少尿及水肿的患者应及时利尿，但同时应注意维持水电解质及酸碱平衡。对急性期血压升高者经休息、限制水盐，利尿而血压仍高者应给予降压药物治疗。对出现高钾血症的患者除利尿外，可以应用离子交换树脂或高糖胰岛素处理。