一般是因为肠道寄生虫蛔虫产生的毒素而刺激肠道，会使肠道蠕动加快引起消化不良，脐周围疼痛而且睡眠不宁。如果毒素刺激神经，使神经兴奋导致磨牙，同时的蛔虫也会分泌毒素并引起肛门瘙痒，影响孩子睡眠，发出磨牙的响声。
一般家长认为磨牙的罪魁祸首是寄生虫，但是近年来，由于卫生习惯的条件改善，寄生虫引起磨牙已经退居次要位置了。精神过度紧张的孩子也会在夜间磨牙，或玩耍过度、精神紧张也会引起磨牙。因此某种事件长期受到家长的责骂，引起压抑不安或焦虑，也是夜间磨牙的重要因素。消化功能紊乱的孩子在夜间吃得过饱，入睡前肠道内积累了不少食物，胃肠道不得到正常的工作，由于负重过量也会引起夜间不自主的磨牙。