中枢神经系统的结核瘤主要通过两个方面进行治疗：
第一，药物治疗，药物治疗以抗结核的药物为主，抗结核药物能够抑制结核瘤的进一步进展，减轻颅内结核的症状，如果患者出现了颅内压升高的症状，要给予患者脱水、降低颅内压的治疗。
第二，进行手术治疗，有些患者颅内的结核瘤比较大，对脑组织的压迫症状比较明显，可以通过手术的方式将结核瘤切除，减轻患者颅内受压的症状。
临床上往往将两种方法结合起来治疗，这样能够更好的对患者进行治疗。