当怀疑脑炎的时候，主要根据患者的病史、临床表现、影像学检查、血常规、脑脊液检查等明确诊断。其中腰穿、脑脊液检查具有重要意义。
在临床当中，很多原因都会引起脑炎，例如细菌、病毒、真菌、结核分枝杆菌感染等，均可以引起脑炎。
一般情况下，病毒性脑炎患者症状较轻，早期通过积极的治疗，患者转归较好，不会遗留有明显的后遗症。真菌性脑炎是一种比较严重的脑炎，发病后会对脑功能造成严重影响，需要积极的抗真菌治疗。如果是结核性脑炎，需要到专科医院进行系统抗结核治疗。