导致急性间质性肾炎的主要原因有药物、感染和自身免疫性损伤。药物是导致急性间质性肾炎的主要原因之一。在所有药物引起的急性间质性肾炎中，约1/3是由抗生素引起的。而非甾体类抗炎药，在部分存在非甾体类抗炎药导致的急性间质性肾炎的患者中，存在着嗜酸性粒细胞浸润和IgE介导的高反应性，过敏反应也认为是非甾体类抗炎药引起急性间质性肾炎的机制之一。利福平引起急性间质性肾炎认为与细胞免疫有关，多在再次服用或间断服用利福平后突然起病，而别嘌醇也是引起急性间质性肾炎的药物之一。
在临床上别嘌醇导致的急性间质性肾炎多见于中老年人，并常伴有多种的皮疹。感染也是导致急性间质性肾炎的一大原因。从广义上来讲，感染相关的急性间质性肾炎包括肾实质感染和全身感染所致。肾实质感染是由微生物直接侵犯肾盂及肾实质，从而引起化脓性的炎症。而全身感染是狭义的感染相关性急性间质性肾炎，此类患者肾组织中很少能检出病原微生物。提示感染可能通过免疫反应介导急性间质性肾炎。