目前为止，中枢神经系统肉芽肿性血管炎的病因尚不明确，考虑可能与病毒的感染有关系。
有资料报道说，患有中枢神经系统肉芽肿性血管炎的患者检测中，发现了有相关病毒感染导致的疾病，比如有病毒感染肝炎，其中主要有乙型肝炎病毒感染及带状疱疹病毒感染，还有HIV等有关的病毒感染的血清学检查证据。所以，上述情况，说明了中枢神经系统肉芽肿性血管炎和病毒感染有关系。
建议如果有病毒感染性疾病，最好及时正规医院专科就诊进一步检查一下看看属于什么情况，再对症治疗，有效预防该病发生。