肛瘘的检查方法有以下几个：
第一、眼睛观察，观察肛门周围外口的位置，以及数量，有经验的肛肠科医生，可以通过外口的位置大致判断内口的位置。
第二、肛门触诊以及指诊，通过摸肛门周围，可以大致判断出瘘管的走行以及内口的位置。
第三、探查，医生可以通过探条自外口进入，探查瘘管的走行以及内口的位置。
第四、辅助检查，比如肛门周围的彩超、ct、磁共振。也可以在术前大致判断肛瘘的瘘管数量走行，以及内口的位置和数量，其中磁共振检查是金标准。