内分泌失调所导致的闭经，在临床上是比较常见的。内分泌失调，是一个比较大的疾病范畴。引起闭经的内分泌系统疾病，最常见的是甲状腺疾病和性腺系统疾病。如甲状腺功能亢进症、甲状腺功能减退症、多囊卵巢综合征伴有高雄激素水平，都是常见的内分泌系统疾病导致闭经的原因。
针对原发病进行调理，月经就会有所改善，如应用抗甲亢用药治疗甲亢；应用优甲乐来治疗甲减；应用达英-35、二甲双胍等来治疗多囊卵巢综合征伴有高雄激素水平。
除此之外，也可以在中医师的指导之下，应用中药来进行调理。