肾结石的患者行开放性手术治疗，其风险一般相对较大。开放性手术时需要将肾脏切开，肾脏属于腹膜后器官，进行手术时，一般从腰部选择切口较多，手术时需要将腰部的肌肉切断，并且容易损伤局部的神经，术后容易出现局部的疼痛和麻木。
结石位于肾脏之内，所以肾脏需要切开，才能将结石取出，容易造成肾脏的严重损伤。手术之后甚至患者可以出现肾脏萎缩，术后出血及漏尿的几率也相对较大。
目前肾结石手术一般以微创手术治疗为主，肾脏切开取石术相对很少选择。微创手术方式可以选择经皮肾镜手术或者是输卵管软镜手术。