贲门失弛缓症有可能需要手术治疗，尤其是有中度或者重度临床表现的患者。通过传统内镜治疗效果欠佳的患者，应该要给予手术治疗，可以做贲门肌层切开术或者是经胸经腹开腹手术，也可以在胸腔镜或者腹腔镜下完成。
但并不是所有的患者都需要通过手术治疗，尤其是患者没有明显的临床表现，偶尔出现吞咽困难。
或者食管反流症状的患者，可以通过保守治疗的方式缓解，包括饮食结构，以及进食习惯的调整，药物的治疗来促进疾病的恢复。